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*三代透明加密技术的特点是，涉密数据使用前，先初始化涉密沙盒，沙盒加密一旦成功，之后所有的数据都是数据实体，不针对文件个体，所以无数据破损等问题。特点是速度快，稳定，但技术相当复杂。 
**代，*二代本质都是采用的针对单个文件实体进行加密，如a.txt内容为1234, 加密后变成@#$%% +标记。@#$%%是把原文1234进行加密之后的密文。而标记的用途是用来区分一个a.txt文件是否是已经被加密。当系统遇到一个文件的时候，首先判断这个标记是否存在，如果存在，表明时被系统加密过的，则走解密读取流程，如果不是加密的，就*解密，直接显示给使用者，只是当保存的时候，再进行加密，使其成文密文+标记。 
这就带来一个巨大的风险：如果是一个较大文件，加密过程中发生异常，标记没加上，那么下次读这个文件的时候，因为没有读到标记，而采用原文读取，然后再加密，那么这个文件就彻底毁坏了。这个现象在**代APIHOOK透明加密技术的产品中特别明显，在*二代文件过滤驱动产品中，因为速度变快了，使文件破损发生概率减低了很多，但并没有本质解决这个问题。 
另外，由于是进程和文件后缀名进行关联，也造成了一个缺陷：很多编程类软件，复杂制图软件的编译，晒图等操作，都是很多进程同时操作某个文件，这个时候进行进程和文件关联显然太牵强了，因为进程太多了。即使进行关联，多个进程交替访问文件，加密解密混在一起，较容易造成异常。所以才会出现VC等环境下如不能编译，调试等。
其他方面，版本管理无法对比，服务器上存放的是密文（服务器存密文，是个较大的风险，目前没有哪家大企业敢这么做，毕竟太依赖加密软件，持续性没有了），大文件速度慢等，一系列问题，无法解决。 
而*三代内核纵深加密技术是在前者2个基础之上发展而来的，每个过滤层都只做自己较擅长的事情，所以特别稳定，速度快，性能可靠，不存在**代和*二代的问题。由于内核级纵深透明加密技术要求高，涉及技术领域广，较其复杂，开发周期长，所以国内的能做开发的厂商不多。目前，成事科技推出的信护宝电子文档安全管理系统，给人一眼**亮的感觉，其产品是*三代透明加密保密技术的典型产品，其产品主要特点是：
1）采用了磁盘过滤，卷过滤，文件过滤，网络过滤等一系列纵深内核加密技术，采用沙盒加密，和文件类型和软件无关，沙盒是个容器。
2）在操作涉密数据的同时，不影响上外网，QQ,MSN等。
3）保密彻底，包括网络上传，邮件发送，另存，复制粘贴，屏幕截取等，特别是屏幕保密，做得非常炫。
4）服务上存放的是明文，客户端存放的是密文，文件上传服务器自动解密，到达客户端自动加密。服务器上明文，减少了业务连续性对加密软件的依赖。
5）不但可以针对普通文档图纸数据进行保密需求，同时更是研发性质的软件公司(游戏，通讯，嵌入式，各种BS/CS应用系统)源代码保密可以选择。